Gromacs è un programma seriale e parallelo adatto alla simulazione della dinamica molecolare di biomolecole di grosse dimensioni. E' piuttosto veloce e ha una buona scalabilità  sulla maggior parte dei calcolatori disponibili. Creato e sviluppato dal gruppo MD dell'università  di Groeningen, permette la simulazione di dinamica molecolare classica e stocastica, e il calcolo dei relativi osservabili chimico-fisici. Uno de maggior vantaggi di Gromacs riguarda la possibilità  di utilizzare diversi campi di forza per la simulazione (come GROMOS96, OPLS, Amber, etc.).

Ulteriori informazioni:
http://www.gromacs.org/